姓名:王珣
现任职务:中国石油大学(华东)计算机科学与技术学院副教授
主要简历:
2003年9月— 2007年6月,青岛大学师范学院数学与应用数学专业
2007年9月— 2010年6月,广西师范大学基础数学专业
2011年4月— 2015年3月,筑波大学社会系统与管理专业
研究方向:人工智能,智慧医疗,生物特征大数据挖掘,生物信息处理、脉冲神经膜系统
主要业绩:
候选人主要从事生物信息处理与高性能计算的研究。近5 年发表SCI 期刊论文30 余篇,其中第一/通讯作者发表SCI 期刊论文16 篇,中科院一、二区期刊论文7 篇,ESI 高被引论文2 篇,入选Journal of Computational Biology 高影响力(High Impact Article)1 篇。主持国家自然科学基金项目2 项,山东省重点研发1 项,中国博士后基金面上项目1 项,参与省部级以上项目10 余项。申请发明专利12 项,授权1 项。主要取得了以下成果:
1. AI赋能的生物信息智感知算法
(1)设计出自组装产生突触的自组装脉冲神经膜系统,首创了自组织神经系统求 解计算问题的理论算法;
(2)发展了“快慢”结合的智能算法的计算理论框架,为生物医学数据的快速融合、准确计算提供技术支持;
(3)针对肝癌、早期肺癌分型/分类诊断、卵巢癌虚拟着色、肝脏肿瘤血管3D 成像、胎儿心脏畸形智能诊断、人脑海马体体积等,提出了病灶精准识别和准确定位的方法;
(4)设计了一系列基于智能研判的医学影像识别核心算法,平台在线支持早期肺癌 分型/分类诊断、肺结节自动识别、胃癌智能筛查卵巢癌虚拟着色、肝脏肿瘤血管3D 成像、人脑海马体体积智能计算等10 余种常见病的智能诊断与解决方案推荐;
(5)参与建设了落地济南的全国首个健康医疗大数据资源平台“国家健康医疗大数据北方中心”。截至 2020 年11月,中心已完成汇集成85 家医院,168 家基层医疗卫生机构,4322 家村居级基层医疗卫生机构电子病历数据,汇聚总量216.45 TB,结构化数据13.19TB,影像4.93 亿张。支持了22 个专病队列的智能化诊断与分析技术的研发,并在4 家三甲医院开展智能诊疗临床应用验证。
(6)作为核心成员,突破了“2K/4K 数字化系统”和“病灶3D 智能诊断”等多项关键技,研发了具有自主知识产权的“智能数字化手术系统”相关成果“智能化手术系统的关键技术及产业化应用”获得 2021年度CCF科学技术奖科技进步杰出奖。
2. 面向异构分布式平台的高性能计算理论
(1)研发了基于国产芯片E级超算天河3F的第一性原理分子动力学算法优化。结合国产芯片架构的特点,设计低IO开销、高并行的优化策略,在单节点实现了165GFlops的峰值计算性能,同比方法实现了4倍的性能提升。
(2)作为核心成员参与搭建了中科院计算所牵头建设的基因数据的高性能处理平台。针对靶向测序在以往的CPU/GPU平台上的吞吐量远低于Nanopore测序仪的通量而硬件设计存在高设计成本和灵活性的问题,对比主流的NVIDIA A100 GPU平台取得了10.84倍加速比。
(3)作为核心成员参与搭建了中科院计算所牵头建设的基于国产芯片的基因数据的高性能处理平台,包括致病基因挖掘算法,蛋白质序列三级结构分析等;构建了支持 新药研发的分子结构预测,在临床新药研发、精准诊疗平台。
(4)参与构建基于国产化芯片搭建的基因数据的高性能处理平台,与中国海洋大学海洋药物研发中心、清华大学药学院、中国人民解放军第302、第304 医院、上海交通大学附属瑞金医院等国内20余家三甲医院和生物医学顶尖团队合作,开展应用药物分子计算的应用合作,在中医药药物分子生物属性预测、药物分子亲和力智能预测、精准诊疗等方面,提供了重要的临床数据分析工具。
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